Fin 2008, le Conservatoire du patrimoine naturel de la Savoie (CPNS, aujourd'hui CEN Savoie) propose de réunir l'ensemble des acteurs œuvrant à la préservation du patrimoine naturel en Savoie : la finalité est de mutualiser et structurer les données naturalistes de chacun pour les mettre à disposition des partenaires et du grand public. Cet outil sera intitulé Portail du patrimoine naturel de la Savoie puis Observatoire de la biodiversité de Savoie.
Depuis cette date, le CEN Savoie anime le projet, coordonne les actions et administre la base de données et le site Internet de l'Observatoire. Celui-ci, entièrement développé par le CEN Savoie, a été inauguré le 18 mai 2011 lors d’une conférence de presse organisée au Muséum d’Histoire Naturelle de Chambéry (siège de la Société d’Histoire Naturelle de Savoie).
Aujourd'hui, l'Observatoire de la biodiversité de Savoie recense 15 082 espèces et 2 553 494 observations.
À noter : les données présentées par l'Observatoire sont le fruit de la mutualisation des connaissances de ses partenaires constitutifs. L'Observatoire ne constitue qu'un ÉTAT DES CONNAISSANCES ACTUELLEMENT RÉPERTORIÉES et ne peut se prévaloir de lister de manière exhaustive les espèces de faune et de flore présentes en Savoie.